В Финляндии в Хельсинки еще нет возможностей для протеомного анализа, а вот у коллег в Швеции такая возможность недавно появилась. Уже сейчас выяснилось, что наши представления о липопротеидах высокой плотности, когда считалось, что там существует один мажорный белок АроА1, и остальная «мелочь» не заслуживает внимания, следует пересматривать. На поверхности липопротеидов высокой плотности, существуют десятки минорных белков, которые на самом деле оказывают серьезное влияние и на метаболизм жиров, и на ингибирование протеазной активности, и на регуляцию воспалительного ответа (на регуляцию синтеза и секрецию белков острой фазы, регуляцию производства комплемента). Взаимодействие липидомных и протеомных частей следует еще очень серьезно изучать. То есть до реального понимания зависимости между структурой и функцией липопротеидов высокой плотности еще очень далеко.

Несколько слов о генах-кандидатах, опосредующих низкий уровень липопротеидов высокой плотности. Проект «Геном человека» можно считать успешно законченным, но как воспользоваться его результатами до сих пор непонятно. Хорошо, что для очень многих параметров выявлена ассоциация каких-то геномных вариантов с определенными состояниями, но каков биологический смысл этих ассоциаций до сих пор неясно. Это относится не только к липидам, а вообще ко всему.

Сами по себе результаты полногеномного исследования было бы трудно интерпретировать, если бы уже не существовали данные помимо широкогеномного исследования. Во-первых, по-прежнему доступны результаты исследования экспрессии генов в интересующих тканях, то есть результаты транскриптомики, и существуют результаты функциональных исследований, об участии которых уже было сказано.

Основываясь на представлениях о комбинации широкогеномных исследований с другими, запустили, но еще не опубликовали исследование в Хельсинки, в котором было включено 450 человек из полногеномного исследования, часть этих людей участвовала в Хельсинском исследовании здоровья 2000 г., еще часть была получена из европейского многоцентрового исследования по семейным дислипидемиям. Отличие этих двух групп заключается в том, что в Хельсинки был взят срез из популяции (обычного населения), в группе пациентов же были люди с нарушениями липидного обмена. Для части людей было сделано липидемическое исследование, и имеются данные по биопсии жировой ткани. Для второй группы (больных с выраженной дислипидемией и преждевременной ишемической болезнью сердца) получены данные по транскриптомике, по экспрессии жиров и разделение по индексу массы тела (по степени ожирения).