В этом исследовании применяется интегрированный анализ с точки зрения геномики. Статистическую силу исследования планируется увеличить путем использования полномасштабных транскриптомных анализов биоптата жировой ткани (Phemethrix-технологии) и данных по липидомике. Предполагается, что при объединении этих подходов можно будет получить не только факты, а какую-то гипотезу о том, каков истинный метаболический путь холестерина при обратном транспорте, обусловленный генетическими изменениями.

Проводится изучение метаболических путей. Проанализированы данные о транскриптомике жировой ткани у одного из пациентов с низким уровнем холестерина липопротеидов высокой плотности. Было установлено, что у этого человека наблюдается повышение экспрессии белков, ответственных за инициирование воспалительной реакции. Исследования, которые продолжаются, в основном, лежат в области изучения функций липопротеидов высокой плотности (для этого сейчас используются более-менее подходящие животные модели, а также функциональные исследования на клеточных культурах) с использованием микрочипов по технологии Phemethrixи подход с молчащей РНК.

Выявили сейчас один транскрипционный фактор, названный USF1 (UnstimulatedSteroidFactor1 – Нестимулированный Стероидный Фактор 1). Транскрипция этого фактора, как оказалось, влияет на показатели метаболизма липидов и метаболизма глюкозы. Судя по списку, здесь практически все, что имеет отношение к липидному метаболизму, подвержено влиянию этого транскрипционного фактора. Этот фактор представляется потенциальной терапевтической мишенью: во-первых, его можно выключить на мышиной модели (сделать нокаутную мышь) и посмотреть, как будет развиваться атеросклероз, во-вторых, можно изучать влияние этого фактора на чисто клеточной модели.

По результатам использования молчащей РНК на культуре клеток гепатоцитов, выяснилось, что выключение с помощью этой молчащей РНК приводило к увеличению секреции АроА1 из культивируемых клеток. Выключение транскрипционного фактора USF1, но не с помощью молчащей РНК, а на нокаутных мышах. Выяснилось, что у гомозигот «-/-» (с полным нокаутом) существенно выше уровень АроА1 и, к тому же, у этих животных существенно выше уровень общего холестерина. Следует учесть, что у животных (мышей) 95 % этого общего холестерина составляют липопротеиды высокой плотности.