Делеция одной пары оснований

Расчет процента гетероплазмии для микроделеций рассмотрим на примере делеции гуанина в позиции 652 митохондриального генома человека (652delG).

Мутацию можно определить по пику нуклеотидов G. В анализируемой последовательности он находится под номером 2. По данным компьютерной программы, при 100% нормальных геномов ( G/G ) пик G составляет 2 единицы, а при 100% геномов с делецией (-/-) пик G составляет 1 единицу. В качестве контроля берем пик G №5, составляющий 2 единицы.

Например, определим процент данной мутации в образце ДНК, взятом

из стенки сосуда 50-летнего мужчины. Размер исследуемого пика G в данном образце составляет 15,73. Размер контрольного пика G – 18,29. Полагая, что 18,29 составляет 2 единицы, вычисляем размер пика, равного 1 единице – 9,15. Далее подставляем значения в формулу.

Таким образом, данный образец ДНК имеет 28% гетероплазмии по 652delG.

Метод определения процента гетероплазмии мутантного аллеля митохондриального генома был опробован на различных органах и тканях, например, здоровой и пораженной атеросклерозом интиме аорты, печени и мышце (мутация G13513A), при этом были выявлены существенные отличия уровня гетероплазмии митохондриального генома между разными тканями, полученными от одного и того же донора аутопсийного материала. Этот феномен требует дальнейшего изучения, поскольку может свидетельствовать о неравномерном и селективном распределении мутантного аллеля по различным тканям в процессе онтогенеза. С другой стороны, это может также свидетельствовать о преимущественном выживании клеток, несущих нормальный (или мутантный) аллель. Кроме того, нельзя также исключить возможность избирательного возникновения соматических мутаций в клетках тканей при локальных неблагоприятных воздействиях.